Análisis de regularidad de genomas para detección de telómeros y secuencias autónomamente replicativas

  • Yuri Morales López Universidad Nacional de Costa Rica
  • Alejandro Ugalde León
  • tatiana Láscaris-Comneno Slepuin

Abstract

Hasta el momento, las levaduras han proporcionadomucha de la información referente a los orígenes eucarióticos de la replicación. La levadura Yarrowia lipolytica ha sido analizada con el fin de generar informaciónque contribuya a la detección de regularidades de interés genético (Ugalde, Morales y Láscaris-Comneno, 2010) mediante la aplicación del índice de máxima regularidad imax,r (Láscaris-Comneno, Skliar y Medina, 1999). En este trabajo, el imax,r se aplica, en particular, al análisis de la secuencia correspondiente al cromosoma IX cosmid 8224 y telómero derecho de la Saccharomyces cerevisiae, lo cual permite detectar el telómero (C1-3)A documentado en la base de datos especializada NCBI; asimismo identificar zonas completamentecontenidas en este rasgo en las cuales el imax,r alcanza su valor máximo de toda la secuencia. El análisis de genomas de la Yarrowia lipolytica por tamaños de ventana menores o iguales que la longitud de sus secuencias replicativas indicó, en todos los casos estudiados, que la región para la cual se obtiene el mayor imax,r se encuentra totalmente contenida en la correspondiente secuencia autorreplicativa.

Author Biographies

Yuri Morales López, Universidad Nacional de Costa Rica
Escuela de Matemática
Alejandro Ugalde León
Escuela de Matemática
tatiana Láscaris-Comneno Slepuin
Escuela de Matemática
Published
2010-01-01
How to Cite
Morales López, Y., Ugalde León, A., & Láscaris-Comneno Slepuin, tatiana. (2010). Análisis de regularidad de genomas para detección de telómeros y secuencias autónomamente replicativas. Uniciencia, 24(1), 103-110. Retrieved from https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/uniciencia/article/view/376
Section
Original scientific papers (evaluated by academic peers)